Η διαπερινεϊκή βιοψία προστάτη συνήθως εκτελείται στα πλαίσια μίας νοσοκομειακής δομής με αναισθησία. Η διαδικασία εκτελείται με τη χρήση υπερήχου από το ορθό όπως και στη διορθική για την απεικόνιση του αδένα αλλά οι βιοψίες λαμβάνονται από την περιοχή ανάμεσα στους όρχεις και το ορθό. Η διαδικασία της διαπερινεϊκής βιοψίας μειώνει τα ποσοστά λοίμωξης έναντι της διορθικής καθώς τα τρυπήματα δε γίνονται από το ορθό, που είναι αποικισμένο με άφθονους μικροοργανισμούς, αλλά από μία περιοχή του δέρματος που καθαρίζεται με διαδικασίες χειρουργικής αντισηψίας.

Την εξέλιξη της διαπερινεϊκής βιοψίας αποτελεί η fusion βιοψία προστάτη, η οποία συνδυάζει τα ευρήματα μίας εξέτασης που λέγεται πολυπαραμετρική μαγνητική τομογραφία προστάτη και η οποία μπορεί να υποδείξει ύποπτες περιοχές για ανάδειξη κακοήθειας, με την εικόνα του υπερήχου. Το εκμαγείο του προστάτη και των υπόπτων περιοχών υποδεικνύεται από τον ακτινολόγο, και κατά τη διαδικασία χρησιμοποιείται λογισμικό που “παντρεύει” το απεικονιστικό εύρημα της μαγνητικής που εκτελείται προεγχειρητικά, με την εικόνα του υπερήχου που λαμβάνεται σε πραγματικό χρόνο την ώρα της επέμβασης. Η παραπάνω διαδικασία μπορεί να βοηθήσει στη λήψη πιο εστιασμένων δειγμάτων από τις ύποπτες περιοχές και έχει τεκμηριωμένα υψηλότερη διαγνωστική ευαισθησία.